Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SptssbQ925E8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SptssbQ925E8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms