Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ripply3Q924S9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ripply3Q924S9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms