Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prss28Q924N9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prss28Q924N9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms