Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EedQ921E6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EedQ921E6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms