Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx4Q91YJ2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms