Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usb1Q91W78 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usb1Q91W78 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms