Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn8Q91VA3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn8Q91VA3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms