Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppargc1bQ8VHJ7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms