Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc71Q8VEG0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc71Q8VEG0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms