Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc115Q8VE99 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc115Q8VE99 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc115Q8VE99 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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