Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx18Q8VDS8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms