Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8VDP2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8VDP2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8VDP2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms