Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam20bQ8VCS3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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