Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RfxapQ8VCG9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RfxapQ8VCG9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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