Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rapgef3Q8VCC8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef3Q8VCC8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms