Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BbxQ8VBW5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BbxQ8VBW5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms