Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApobrQ8VBT6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms