Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r200Q8R281 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Vmn1r200Q8R281 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms