Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf183Q8QZS5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf183Q8QZS5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms