Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Treml1Q8K558 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Treml1Q8K558 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms