Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc5Q8K4Z2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc5Q8K4Z2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms