Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vmn1r72Q8K3N7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vmn1r72Q8K3N7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms