Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Prpf39Q8K2Z2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prpf39Q8K2Z2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms