Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccm2Q8K2Y9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccm2Q8K2Y9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms