Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr1eQ8K202 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr1eQ8K202 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms