Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms