Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rasgef1bQ8JZL7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasgef1bQ8JZL7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms