Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps50Q8CI71 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps50Q8CI71 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms