Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf1aQ8CHZ9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms