Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Csnka2ipQ8CH19 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Csnka2ipQ8CH19 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Csnka2ipQ8CH19 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Csnka2ipQ8CH19 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Csnka2ipQ8CH19 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Csnka2ipQ8CH19 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csnka2ipQ8CH19 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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