Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nedd4lQ8CFI0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms