Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkl1Q8CEQ0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms