Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkiras1Q8CEC5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms