Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramef8Q8CE24 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pramef8Q8CE24 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Pramef8Q8CE24 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pramef8Q8CE24 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pramef8Q8CE24 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Pramef8Q8CE24 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef8Q8CE24 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms