Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vcpip1Q8CDG3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vcpip1Q8CDG3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms