Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dclre1bQ8C7W7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dclre1bQ8C7W7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms