Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp20Q8C6M1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp20Q8C6M1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp20Q8C6M1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp20Q8C6M1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp20Q8C6M1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp20Q8C6M1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp20Q8C6M1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp20Q8C6M1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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