Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rdh12Q8BYK4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdh12Q8BYK4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms