Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3dQ8BX13 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ube3dQ8BX13 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ube3dQ8BX13 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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