Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctdsp2Q8BX07 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms