Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl16Q8BSU2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cxcl16Q8BSU2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl16Q8BSU2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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