Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRT5

A830005F24Rik, RIKEN cDNA A830005F24, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A830005F24RikQ8BRT5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
A830005F24RikQ8BRT5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms