Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gga3Q8BMI3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gga3Q8BMI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms