Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zcchc4Q8BKW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms