Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnrc6bQ8BKI2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms