Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan9Q8BJU2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms