Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcal1Q8BJL0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms