Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4bQ8BGE6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms