Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M10.3Q85ZW6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-M10.3Q85ZW6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms