Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc50Q810U5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc50Q810U5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms